Может быть поздно с советом,но всё же:
столкнулся с такой же проблемой,тумба под рио240,внешник эхейм 2036.Подсмотрел на одном форуме вот такой вариант:
повесить полки на 15 см от дна аквариума. Для этого взять дрель-шуруповерт и сверло на 5 мм, высверлить отверстия и повесить полочки, теперь ничего не мешает и очень удобно